Realiza sus estudios musicales en los Conservatorios de Albacete, Valencia y Madrid, cursando las carreras de Dirección de Orquesta, Dirección de Coros, Clarinete, Flauta Barroca, Piano, Solfeo y Teoría de la Música, Transposición y Acompañamiento, Armonía, Contrapunto, Composición e Instrumentación. Es discípulo del insigne maestro Enrique García Asensio.

Ha ganado numerosos e importantes concursos: Dirección de Orquesta del Conservatorio de Madrid 1995. Dirección de Coros del Conservatorio "Joaquín Rodrigo" Valencia 1992. Mención de honor, en la máxima categoría, del Certamen Internacional "Ciudad de Valencia" 1999. Concursos nacionales de composición "Ciudad de Orihuela" 2004; "Maestro Turrillas" del Ayuntamiento de Pamplona 2007; y "Maestro Francisco García Muñoz" del Ayuntamiento de Soria 2008.

Es académico y vocal de la Junta de Gobierno de la Muy Ilustre Academia de la Música Valenciana, miembro de la AIE y de la SGAE. Cuenta con más de tres centenares de obras registradas y otros tantos fonogramas y videogramas. Sus instrumentaciones para banda, tanto de música lírica como del repertorio sinfónico, son referentes en la actualidad para las bandas sinfónicas.

Es invitado a dirigir las Bandas Municipales más importantes del estado: Alicante, Almería, Barcelona, Bilbao, Castellón, La Coruña, Madrid, Melilla, Santiago de Compostela, Sevilla, Tenerife, Valencia..., así como jurado en los más relevantes certámenes nacionales e internacionales de composición e interpretación.

En el ámbito docente, Fernando Bonete obtiene plaza de profesor de Armonía y Melodía Acompañada por oposición libre del Conservatorio de Zamora; y pertenece, por concurso-oposición, al Cuerpo de Profesores de Enseñanza Secundaria en la especialidad de Música, y al Cuerpo de Profesores de Música y Artes Escénicas en la especialidad de Coro y Orquesta.

Ha ocupado por oposición libre la plaza de Director de la Banda Municipal de Albacete desde 1999 hasta 2012, habiéndose conseguido bajo su mandato la completa profesionalización de la misma.

Desde 2012 es Director Titular de la Banda Municipal de Valencia.